אגף המכס והמע"מ מקיים בכפוף לחוק סוכני המכס, בחינות למעוניינים לפעול כסוכן מכס.
סוכן המכס הוא נציגו של היבואן או היצואן מול רשויות המכס בכול הקשור לרישיונות יבוא ויצוא, סיווג והערכה, התרת הטובין מרשות המכס ביבוא ויצוא וכו'.
חוק סוכני המכס קובע כי יחיד יהא כשיר להירשם כסוכן מכס אם נתקיימו בו כל אלה:
(1) הוא תושב ישראל;
(2) הוא בגיר;
(3) הוא בעל השכלה תיכונית;
קבלת תעודת סוכן מכס, לאחר סיום הלימודים, כפופה לכך שהמועמד
א. הוא עמד בבחינות שקבע המנהל, בנושאים שקבע בהתייעצות עם הועדה ואשר פורסמו ברשומות.
ב. הוא עבר תקופת התמחות של שנתיים לפחות, כפי שנקבע בתקנות, אצל סוכן מכס בעל ותק של חמש שנים לפחות, שנתקיימו בו התנאים שנקבעו בתקנות;